用戶簡介：
哈爾濱師範大(dà)學坐落于素有“冰城夏都”美譽的曆史文化名城哈爾濱，是黑龍江省教育、藝術、人文社會科學和自然科學的重要人才培養基地和科學研究基地，是黑龍江省屬重點建設的高水平大(dà)學，是教育部本科教學工(gōng)作水平評估優秀學校。學校是國家“中(zhōng)西部高校基礎能力建設工(gōng)程”高校，是“十三五”時期國家重點支持建設的百所中(zhōng)西部本科院校之一(yī)。
學校成立于1951年，其前身是1946年我(wǒ)黨在東北(běi)解放(fàng)區建立的松江省立行知(zhī)師範學校，經曆了哈爾濱師範專科學校（1951——1956）、哈爾濱師範學院（1956——1980）時期，1980年更名爲哈爾濱師範大(dà)學。2000年呼蘭師範專科學校、黑龍江農墾師範專科學校并入，2002年黑龍江省物(wù)資(zī)學校（黑龍江省物(wù)資(zī)職工(gōng)大(dà)學）并入，組建成新的哈爾濱師範大(dà)學。
應用場景-用于分(fēn)子動力學模拟：
大(dà)自然并不友善”---在紀錄世界各地瘟疫爆發過程的《逼近的瘟疫》一(yī)書(shū)中(zhōng)曾這樣提過。埃博拉、HIV、沙拉……這些病毒我(wǒ)們曾談之色變，地球在孕育生(shēng)命的同時，危險也在悄悄潛伏，人類需要在病毒面前盡快找出可以攻克的藥物(wù)。分(fēn)子動力學模拟被廣泛的應用在現代藥物(wù)開(kāi)發設計中(zhōng)，常被稱爲人類戰勝病毒的“武器”。
想要了解生(shēng)命活動過程并進行針對性的藥物(wù)設計，僅僅知(zhī)道病毒的基因序列是不夠的，折疊成三維立體(tǐ)構像的活性蛋白(bái)質及相關複合物(wù)才是關鍵，通過研究和分(fēn)析相關蛋白(bái)質，找到可以和藥物(wù)分(fēn)子有特異性相互作用的靶點，才能最終成功開(kāi)發出可以治療這項疾病的藥物(wù)。
分(fēn)子動力學模拟可以通過計算原子之間的相互作用，求解牛頓方程，來模拟體(tǐ)系中(zhōng)原子和分(fēn)子的運動，它所産生(shēng)的豐富構像是解釋生(shēng)命活動現象、設計藥物(wù)分(fēn)子所不可或缺的重要手段。
分(fēn)子動力學模拟對高性能計算的需求：
在分(fēn)子動力學模拟中(zhōng)，一(yī)般需要模拟微秒級或毫秒級的病毒或腫瘤蛋白(bái)折疊過程才能積累到足夠的樣本量，因此必須要用到高性能計算來進行分(fēn)子動力學模拟。但是，計算過程中(zhōng)各節點間的通訊、負責均衡等問題都會對高性能計算在分(fēn)子動力學模拟中(zhōng)的應用産生(shēng)影響。
天翺解決方案：
計算節點選擇天翺RS272-H8，RS272-H8是天翺公司推出的一(yī)款支持AMD最新Rome多核處理器超算産品，支持AMD EPYC™ 7002 Series系列CPU。
計算節點采用雙路EPYC 7742處理器，256G DDR4 2933内存， 處理器擁有強勁的128核256線程處理能力，支持DDR4 3200 MHz Registered ECC内存，最高可支持4TB内存。
管理節點采用RS272-S8服務器，RS272-S8采用雙路AMD EPYC™ 7002 Series系列處理器，最多可以支持4TB内存，熱插拔硬盤。考慮到節點數據存取比較頻(pín)繁的特點，内存擴展爲128G，硬盤擴展爲多塊熱插拔SSD硬盤，組成陣列。管理節點同時也是用戶登陸節點。網絡方面，采用雙網模式。計算網用于并行計算時的數據交換和計算通訊，無論是通信次數還是通信量都很大(dà)，對網絡的延遲和帶寬都有較高的要求。針對這一(yī)特點我(wǒ)們采用Infiniband網絡作爲計算網絡，Infiniband技術是采用RDMA傳輸機制實現了低遲，高帶寬的新型網絡标準，在數據存儲節點中(zhōng)加入infiniband和計算節點管理節點進行互聯，滿足應用的需要。而管理節點主要是進行一(yī)些必要的計算節點;數據存儲系統管理、監控、登入等管理，同時又(yòu)作爲數據傳輸網絡的備份，對網絡性能的要求不高，千兆網絡即可滿足。
天翺 RS272-H8 高性能計算來進行分(fēn)子動力學模拟方式的同時，顯著高性能計算模拟能力，可支持教學機構對教學質量進行高效分(fēn)析，促進教學改進以及優化教學内容， 更适用于各種虛拟化解決方案、大(dà)數據分(fēn)析、以及其他需要更高靈活性、更高性能、更大(dà)存儲能力的應用場景。也廣泛的應用在現代藥物(wù)開(kāi)發設計中(zhōng)，爲人類找出戰勝病毒的“武器”。
